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高通量转录组测序的数据分析与基因发掘

周华;张新;刘腾云;余发新;

高通量转录组测序(RNA-seq)是在转录组水平上进行深度测序的一项技术,为真核生物转录组学的研究开创了新平台,但同时测序所得到的海量数据的生物信息学分析成为科研工作者的一大挑战。对转录组测序技术进行了阐述,重点介绍了转录组测序后的数据分析,以及在真核生物尤其是非模式物种中的基因发掘方法。

2012 年 05 期 v.30;No.133 ;
[下载次数: 10,560 ] [被引频次: 411 ] [阅读次数: 597 ] HTML PDF 引用本文

基于密度泛函理论的第一性原理赝势法

熊志华,孙振辉,雷敏生

第一性原理计算方法有着半经验方法不可比拟的优势,基于密度泛函理论第一性原理赝势法已经成为现代材料计算和设计的重要基础和核心技术。本文对基于局域密度泛函理论的第一性原理赝势法进行了扼要分析。

2005 年 01 期 ; 江西省自然科学基金资助项目(0212018);; 江西省电子与通信重点实验室开放基金项目(2004008)。
[下载次数: 9,605 ] [被引频次: 258 ] [阅读次数: 306 ] HTML PDF 引用本文

短链脂肪酸与肠道菌群

陈燕;曹郁生;刘晓华;

根据近年来国外有关研究进展,综述了肠道短链脂肪酸(SCFAs)的产生、代谢及其重要生理功能。介绍了肠道菌群在SCFA产生代谢中的重要作用。

2006 年 01 期 ;
[下载次数: 4,285 ] [被引频次: 206 ] [阅读次数: 457 ] HTML PDF 引用本文

分形理论及其应用

刘莹;胡敏;余桂英;李小兵;刘晓林;

分形理论是现代非线性科学中的一个重要的分支,是科学研究中一种重要的数学工具和手段。介绍了分形理论的基本概念,给出了分形理论的重要参数分形维数的几种常见定义和计算方法。重点介绍了分形理论在从自然科学到社会科学的各个领域,如工程技术、物理、化学、生物医学、材料科学、天文地理、经济管理、计算机图形学等学科领域的应用及其最新的进展情况。最后,展望了分形理论的应用前景及其发展方向,提出分形理论将面临和有待解决的问题。

2006 年 02 期 ; 国家自然科学基金资助项目(50275071);; 南昌大学科研基金项目(z02879)
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江西省森林碳储量与碳密度研究

王兵;魏文俊;

为探索和估算我国森林碳汇功能提供准确和可靠的基础数据,利用江西省森林资源二类清查资料,运用材积源生物量法对江西省森林碳储量和碳密度进行了研究。森林植被乔木层碳密度的特征为,全省不同森林类型碳密度由大到小依次为硬阔林、针阔混交林、毛竹林、国外松林、杉木林、软阔林、灌木林、马尾松林和经济林;乔木层碳密度随着林龄的增加而增大,随着人口密度的增加而降低。不同森林碳储量由大到小依次为杉木林、马尾松林、硬阔林、灌木林、经济林、毛竹林、针阔混交林、国外松林和软阔林,全省南部和中西部要高于中东部和北部。江西省森林总碳储量为1.5G t C,占全国森林总碳储量的5.33%。

2007 年 06 期 No.104 ; 国家自然科学基金重大项目(30590381-06);; 江西大岗山森林生态系统定位研究(2001-06);; 江西大岗山国家级森林生态站和国家林业局森林生态环境重点实验室资助项目
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江西省森林生态系统服务功能及其价值评估研究

王兵;李少宁;郭浩;

构建了适合江西省森林生态系统服务功能的评价指标体系,依据大岗山森林生态站长期、连续观测数据及多年科研成果,利用2次资源清查资料及社会公共数据估算了江西省"九五"和"十五"期间森林生态系统服务功能的总价值。结果表明:"九五"期间平均每年总价值为7 010.53亿元,单位面积价值为7.88万元/(hm2.a);"十五"期间为7 241.017亿元,单位面积价值为7.24万元/(hm2.a)。总价值增长3.29%,单位面积价值减少了1.26%。在7项服务功能中,其大小顺序依次均为:涵养水源>固碳制氧>保护生物多样性>净化大气环境>保育土壤>林木营养积累>森林游憩与生态文化。"十五"期间各森林类型总价值大小顺序为:杉木>马尾松>栎类>其它硬阔>经济林>竹林>其它软阔>楠木>阔叶混>樟树>檫木>桐类>针阔混,单位面积价值大小顺序为:栎类>桐类>其它硬阔>樟树>其它软阔>楠木>檫木>阔叶混>竹林>马尾松>针阔混>经济林>杉木。

2007 年 05 期 No.103 ; 国家林业局森林生态环境重点实验室基金;; 国家林业局重点项目(2001-06)(江西大岗山国家级森林生态站资助)
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半夏研究进展

毛子成,彭正松

半夏是一种重要的中药材 ,其生存环境遭到日益严重破坏 ,造成半夏资源匮乏。为保护和开发这一重要药材资源 ,已对其进行了系列的研究。本文介绍了半夏的人工载培、组织培养与快速繁殖等方面的研究成果 ,并对半夏研究的趋势进行了探讨。半夏蛋白是一种从半夏块茎鲜汁中提取出来的植物蛋白 ,它是一种植物凝集素 ,具有抗肿瘤、抗生育等重要的生理作用 ,本文对其也进行了阐述

2002 年 01 期 ; 四川省教育厅重点科研项目 (2 0 0 0— 46) ;; 四川省科技厅青年基金项目资助课题
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海泡石的改性研究

李松军,罗来涛

海泡石具有巨大比表面和独特孔结构 ,资源丰富 ,价格低廉 ,是一种新型的催化材料。详细地叙述了海泡石的改性方法及其催化性能 ,评述了它的研究进展和发展动向

2001 年 01 期 ; 国家自然科学基金资助项目! ( 2 98630 0 2 )
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箱法和涡度相关法测碳通量的比较研究

宋霞,刘允芬,徐小锋

对箱法和涡度相关法测定碳通量进行了比较分析,指出了两种方法的理论基础及其实际应用等各方面的优缺点。其箱法原理简单、仪器价格便宜、操作容易、移动便利、灵敏度高,适宜进行小尺度测量,是生态系统机理方面研究的有力工具,是农田和草地等生态系统碳通量测量的主要方法;但是由于箱法效应的存而削弱了观测气体的空间变化性,箱体本身会扰动土壤环境而改变CO2浓度梯度、气压梯度、湍流震动和气流,从而影响测定的通量值。涡度相关法对观测环境不会造成扰动,能够得到长期连续的通量数据,可以用来测定较大尺度的下垫面通量;但是涡度相关技术在观测时仍然受限于一些环境条件:上风向没有足够的下垫面,晚间大气比较稳定,湍流较弱,测定仪器下方存在点源等因素都可以造成涡度相关技术测定精确性的降低。

2003 年 03 期 ; 中国科学院知识创新工程重大项目子专题"中亚热带丘陵山地人工林生态系统碳通量观测研究"(编号:KZCX1-SW-01-01A2);; 中科院地理科学与资源研究所知识创新工程主干科学计划专题"红壤丘陵区人工林生态系统碳通量的观测与模型研究"(编号:CX10G-E01-03-05)资助
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叶绿体DNA分析技术及其在植物系统学研究中的应用

李健仔,李思光,罗玉萍,万璐

叶绿体DNA在植物系统学研究中已得到广泛应用。综述了DNA杂交、DNA限制酶谱分析、RFLP分析、PCR_RFLP分析、微卫星序列分析、SSCP分析和核酸序列分析等叶绿体DNA分析技术的原理、特点及应用

2002 年 03 期 ; 国家自然科学基金资助项目 ( 3996 0 0 0 7);; 江西省自然科学基金资助项目 ( 9830 2 7)
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